Curriculum Vitae
Mots-clés Recherche
Chimie Informatique et Théorique | Modélisation Moléculaire | Biomolécules | Réactivité Enzymatique |
Chimie Quantique | Mécanique Moléculaire | Méthodes QM/MM | Dynamique Moléculaire |
Méthodes Semiempiriques | Algorithme à croissance linéaire | Chemins de Réactions | pKa dans les protéines |
Positions
- depuis 2020: Infrastructure Architect chez Rakuten Group, Tokyo, Japon
- 2016-2020: Directeur du Mésocentre de calcul intensif EXPLOR, hébergé par l'Universitaire de Lorraine
- depuis 2007: Professeur de Chimie Informatique et Théorique, Université de Lorraine (PR1 depuis 2016, mis en disponibilité depuis 2020)
- 1999-2007: Maître de Conférences en Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I
- 1998-1999: Post-doctorant, Pennsylvania State University (Direction: Prof. Kenneth M. Merz, Jr.)
Education
- 2006: Habilitation à Diriger des Recherches, Université Henri Poincaré - Nancy I
- 1994-1998: Doctorat en Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I sous la direction du Prof. Jean-Louis Rivail
- 1993-1994: D.E.A. de Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I
- 1991-1995: Normalien, Magistère de Chimie-Physique, Ecole Normale Supérieure de Lyon (ENS Lyon)
- 1989-1991: Classes préparatoires aux Grandes Ecoles, Lycée Louis-Le-Grand, Paris
Recherche
Activités de Recherche
- Production scientifique: 48 articles dans des journaux internationaux à comité de lecture
- Autres publications: 3 chapitres d'ouvrage
- h-index: 26 (source: Google Scholar)
- Conférences invités: 20
- Cours invités (hors Université de Lorraine): 7
- Séminaires: 13
Encadrement de la recherche
- 8 doctorants
- 11 étudiants niveau Master
Contrats, subventions, distinctions
Collaborations Scientifiques (comme porteur) | Années | Sources de financement |
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Bogazici University, Turquie | 2013-2014 | CNRS - Tubitak |
2009-2010 | CNRS - Tubitak | |
2006-2007 | PHC Bosphore | |
Istanbul Technical University, Turquie | 2016-2017 | PHC Bosphore |
2014-2015 | PHC Bosphore | |
University of Copenhagen, Danemark | 2010 | Ambassade de France |
2010 | French-Danish mobility program |
Contrats de recherche industrielle | Années |
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Sanofi Aventis | 2003-2005 |
Aventis Pharma | 2001-2002 |
Collaborations Scientifiques (comme participant) | Années | Source de financement |
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ANR Blanche: CREAM | 2009-2012 | Agence Nationale de la Recherche |
ACI IMPBio: SIRE | 2004-2007 | MENSR |
ACI GRID: GRID-ASP | 2002-2005 | MENSR |
Organisations de conférences internationales
- 2 workshops CECAM
- 1 meeting ACS
Enseignement
- Licence Physique-Chimie 1ère année : Atomistique et Liaisons Chimiques
- Licence Sciences de la Vie 1ère année : Atomistique et Liaisons Chimiques
- Classe Préparatoire Universitaire (CPU) 1ère et 2ème année
- Master Chimie 1ère année: Modélisation Moléculaire
- Master Chimie 2ème année: Biopolymères et Modélisation Moléculaire des Systèmes Biologiques
- Réseau Français de Chimie Théorique (niveau Master): Méthodes QM/MM, Fortran, Python, Unix, Méthodes à croissance linéaire, ...
Administration de la recherche
Responsabilités Académiques
- Directeur d'EXPLOR (mésocentre de calcul régional, budget 2015-18: 3.1 M€, équipe: 4.5 ETP)
- Membre élu du Conseil de Laboratoire SRSMC (2015-2017)
- Membre du bureau du GDR CORREL (Correlated Methods for Electronic Structure) depuis 2011
- Membre du bureau du Réseau Français de Chimie Théorique depuis 2010 (dont responsable du Pôle Nord-Est 2010-2014); responsable/mainteneur de la liste de diffusion
rctf-membres@asso.univ-lorraine.fr
Expertise et activités éditoriales
- Membre de l'équipe de développement du logiciel AMBER
- Membre du comité éditorial de Computational Chemistry Highlights
- Expert pour l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) et Grand Equipement National du Calcul Intensif (GENCI)
- Membre du Comité Scientifique du Mésocentre de calcul de l'Université de Strasbourg (depuis 2017)
- Participations à des jurys de thèse et HDR: 19 dont 4 à l'étranger (Espagne, Turquie)
- Participations à des comités de sélection: 4
- Revue pour différents journaux internationaux à comité de lecture: Eur. J. Med. Chem., J. Chem. Inf. Model., J. Chem. Theory. Comput., J. Mol. Biochem., J. Molec. Model., J. Phys. Chem., Theor. Chem. Acc., etc.
Autres
- Membre de l'American Chemical Society (ACS) et de la Société Française de Biophysique (GGMM: Groupe de Graphisme et de Modélisation Moléculaire)
- Langage de programmation: C, Fortran, Python, MPI, OpenMP, Cuda, Calcul Haute Performance (HPC)
- Utilisation des moyens de calculs régionaux et nationaux; calcul sur GPU
- Développement web: html, wiki, SQL, mailing-list
- Gestion de version: git
- Administration systèmes et réseaux: installation et administration d'un cluster >500 coeurs + machines de stockage + réseaux + file d'attente
- 1997: Service militaire de 12 mois comme Scientifique du Contingent au laboratoire Structure et Réactivité aux Interfaces, Université Pierre et Marie Curie, Paris