Curriculum Vitae

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Mots-clés Recherche

Chimie Informatique et Théorique Modélisation Moléculaire Biomolécules Réactivité Enzymatique
Chimie Quantique Mécanique Moléculaire Méthodes QM/MM Dynamique Moléculaire
Méthodes Semiempiriques Algorithme à croissance linéaire Chemins de Réactions pKa dans les protéines

Positions

  • depuis 2020: Infrastructure Architect chez Rakuten Group, Tokyo, Japon
  • 2016-2020: Directeur du Mésocentre de calcul intensif EXPLOR, hébergé par l'Universitaire de Lorraine
  • depuis 2007: Professeur de Chimie Informatique et Théorique, Université de Lorraine (PR1 depuis 2016, mis en disponibilité depuis 2020)
  • 1999-2007: Maître de Conférences en Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I
  • 1998-1999: Post-doctorant, Pennsylvania State University (Direction: Prof. Kenneth M. Merz, Jr.)

Education

  • 2006: Habilitation à Diriger des Recherches, Université Henri Poincaré - Nancy I
  • 1994-1998: Doctorat en Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I sous la direction du Prof. Jean-Louis Rivail
  • 1993-1994: D.E.A. de Chimie Informatique et Théorique, Université Henri Poincaré - Nancy I
  • 1991-1995: Normalien, Magistère de Chimie-Physique, Ecole Normale Supérieure de Lyon (ENS Lyon)
  • 1989-1991: Classes préparatoires aux Grandes Ecoles, Lycée Louis-Le-Grand, Paris

Recherche

Activités de Recherche

  • Production scientifique: 48 articles dans des journaux internationaux à comité de lecture
  • Autres publications: 3 chapitres d'ouvrage
  • h-index: 26 (source: Google Scholar)
  • Conférences invités: 20
  • Cours invités (hors Université de Lorraine): 7
  • Séminaires: 13

Encadrement de la recherche

  • 8 doctorants
  • 11 étudiants niveau Master

Contrats, subventions, distinctions

Collaborations Scientifiques (comme porteur) Années Sources de financement
Bogazici University, Turquie 2013-2014 CNRS - Tubitak
2009-2010 CNRS - Tubitak
2006-2007 PHC Bosphore
Istanbul Technical University, Turquie 2016-2017 PHC Bosphore
2014-2015 PHC Bosphore
University of Copenhagen, Danemark 2010 Ambassade de France
2010 French-Danish mobility program
Contrats de recherche industrielle Années
Sanofi Aventis 2003-2005
Aventis Pharma 2001-2002
Collaborations Scientifiques (comme participant) Années Source de financement
ANR Blanche: CREAM 2009-2012 Agence Nationale de la Recherche
ACI IMPBio: SIRE 2004-2007 MENSR
ACI GRID: GRID-ASP 2002-2005 MENSR

Organisations de conférences internationales

  • 2 workshops CECAM
  • 1 meeting ACS

Enseignement

  • Licence Physique-Chimie 1ère année : Atomistique et Liaisons Chimiques
  • Licence Sciences de la Vie 1ère année : Atomistique et Liaisons Chimiques
  • Classe Préparatoire Universitaire (CPU) 1ère et 2ème année
  • Master Chimie 1ère année: Modélisation Moléculaire
  • Master Chimie 2ème année: Biopolymères et Modélisation Moléculaire des Systèmes Biologiques
  • Réseau Français de Chimie Théorique (niveau Master): Méthodes QM/MM, Fortran, Python, Unix, Méthodes à croissance linéaire, ...

Administration de la recherche

Responsabilités Académiques

  • Directeur d'EXPLOR (mésocentre de calcul régional, budget 2015-18: 3.1 M€, équipe: 4.5 ETP)
  • Membre élu du Conseil de Laboratoire SRSMC (2015-2017)
  • Membre du bureau du GDR CORREL (Correlated Methods for Electronic Structure) depuis 2011
  • Membre du bureau du Réseau Français de Chimie Théorique depuis 2010 (dont responsable du Pôle Nord-Est 2010-2014); responsable/mainteneur de la liste de diffusion rctf-membres@asso.univ-lorraine.fr

Expertise et activités éditoriales

  • Membre de l'équipe de développement du logiciel AMBER
  • Membre du comité éditorial de Computational Chemistry Highlights
  • Expert pour l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) et Grand Equipement National du Calcul Intensif (GENCI)
  • Membre du Comité Scientifique du Mésocentre de calcul de l'Université de Strasbourg (depuis 2017)
  • Participations à des jurys de thèse et HDR: 19 dont 4 à l'étranger (Espagne, Turquie)
  • Participations à des comités de sélection: 4
  • Revue pour différents journaux internationaux à comité de lecture: Eur. J. Med. Chem., J. Chem. Inf. Model., J. Chem. Theory. Comput., J. Mol. Biochem., J. Molec. Model., J. Phys. Chem., Theor. Chem. Acc., etc.

Autres

  • Membre de l'American Chemical Society (ACS) et de la Société Française de Biophysique (GGMM: Groupe de Graphisme et de Modélisation Moléculaire)
  • Langage de programmation: C, Fortran, Python, MPI, OpenMP, Cuda, Calcul Haute Performance (HPC)
  • Utilisation des moyens de calculs régionaux et nationaux; calcul sur GPU
  • Développement web: html, wiki, SQL, mailing-list
  • Gestion de version: git
  • Administration systèmes et réseaux: installation et administration d'un cluster >500 coeurs + machines de stockage + réseaux + file d'attente
  • 1997: Service militaire de 12 mois comme Scientifique du Contingent au laboratoire Structure et Réactivité aux Interfaces, Université Pierre et Marie Curie, Paris